أُنشئت كلية العلوم - الفرع الخامس بموجب المرسوم رقم 3526 تاريخ 10 تشرين الثاني 1986، واقتصرت الدراسة فيها على مواد الحلقة الأولى قبل إنشاء الحلقة الثانية بموجب المرسوم رقم 2070 تاريخ 29 أيار 2009.

تتوافر في الفرع الاختصاصات الآتية:

مرحلة الإجازة

1.     الرياضيات

2.     الرياضيات التطبيقية

3.     الفيزياء

4.     الكيمياء

5.     الكيمياء الحياتية

6.     علوم الحياة والأرض

وتتبع للفرع شعبة بنت جبيل، حيث تتوافر فيها السنة الأولى من الإجازة في الاختصاصات المذكورة أعلاه.

تعاقب على إدارة الفرع كل من:

·       الدكتور حسن كامل زين الدين: 1986 – 1988 و1992 - 2000

·       الدكتور خالد أديب فخر الدين: 1988 – 1992

·       الدكتور أكرم عقيل داغر: 2000 – 2007

·       الدكتورة يمامة فايز شريم: 2007 – 2012

·       الدكتور محمود أحمد سرور: 2012 – 2015

·       الدكتور وسام حبيب جمعة: 2015 – 2018

·       الدكتور وسيم عبد الله رمال: 2018 – 2021

·       الدكتور محمد اسماعيل توبي: 2021 - 2024

·       الدكتور وسيم عبد الله رمال: 2024 – حتى اليوم